RPA+CRISPR一管双检,翌圣原料解决方案
RPA+CRISPR一管双检,翌圣原料解决方案
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2026-11-13
现性传播感染防控存在双重负担,“一次采样、同步检测人类免疫缺陷病毒(HIV,RNA病毒)和梅毒(TP,DNA细菌)” 已成为现实刚需。
ACS Sensors 新近报道了一种HIV和TP一体化检测方案,将逆转录、RPA、IVT 以及 Cas12a/Cas13a 双 CRISPR 酶检测整合于单管,37℃等温反应,搭配按压式血浆分离芯片与手机判读,可在 30 分钟内完成从全血到检测结果的全过程。

图1:双靶点检测全流程示意图
这套体系的难点,不在 “怎么设计 CRISPR RNA(crRNA)”,而是怎么让多酶在同一管、同一温度下互不打架。
该体系核心是在单管内同步完成多重酶促反应,难点在于区分 HIV(RNA 靶标)与梅毒螺旋体(DNA 靶标)信号;方案不依靠荧光编码或空间分隔,而是利用 Cas12a 识别 DNA、切割 ssDNA 探针,Cas13a 识别 RNA、切割 ssRNA 探针的底物特异性实现信号正交:
HIV 的 RNA 经逆转录、RPA 扩增后由 Cas12a 触发 FAM 绿光信号;
梅毒靶标经 RPA 引入 T7 启动子、IVT 生成 RNA 后由 Cas13a 触发 ROX 红光信号;
两条通路共管 37℃等温反应。配套按压芯片省去核酸提取,依靠血浆分离膜去除血液抑制物,滤液直接复溶冻干试剂。

图2:双“通道”检测原理简图
把反应按顺序拆开,会发现每支酶面对的约束并不一样。
2.1逆转录酶:把 RNA 靶标翻译成 DNA 语言
HIV 通路第一步的逆转录酶(reverse transcriptase,RT),需要在 37℃、组分复杂的一锅体系中工作,区别于常规 RT-qPCR;它要求逆转录效率高、RNase H 活性可控,且低甘油适配冻干。一锅法对逆转录酶更看重稳定性,需要适当提高酶量,保证启动快,同时避免提前消耗模板。

图3:逆转录酶作用原理图
2.2RPA 的核心蛋白,加上几个容易被忽略的配角
RPA 依靠重组酶在常温下解链扩增:UvsX、UvsY、gp32 和 Bsu 聚合酶四酶配比是扩增关键;UvsX 消耗 ATP,需要肌酸激酶 - 磷酸肌酸 ATP 再生系统持续供能,荧光探针体系还可搭配 Exo III,Tris、钾盐、PEG、DTT、镁离子等缓冲组分同样影响反应启动。另外商品化酶常含高甘油,不利于冻干,一锅冻干体系优先选用无甘油或低甘油酶。

图3:RPA工作原理图
2.3T7 RNA 聚合酶:给第二条通道“造”一个 RNA 靶标
梅毒靶标为 DNA,但 Cas13a 仅识别 RNA,在 RPA 引物上引入 T7 启动子,以 RPA 扩增产物为模板,由 T7 RNA 聚合酶原位转录生成 RNA 供 Cas13a 检测。
这要求 T7 聚合酶在 37℃、多酶共存体系中稳定活性:转录太强会竞争核糖核苷三磷酸(rNTP) 升高背景,转录不足则靶标不够;优先选择低双链 RN(dsRNA)、批间稳定的 T7,相比单纯追求高酶活更合适。
2.4Cas12a:识别只是第一步,反式切割才是信号放大器
Cas12a 具备信号放大效应:crRNA 引导其结合 DNA 靶标激活后,可非特异性切割周围 ssDNA 报告探针,实现一靶多信号。
一锅法存在一个难点:Cas 蛋白会顺式切割原始靶标,在扩增产物足量前提前消耗模板;可通过 crRNA 识别位点设计与组合筛选规避该问题,同时 Cas 的比活性、切割偏好及批间稳定性,直接决定体系可重复性。

图4:Ca12a作用原理图
2.5RNA 酶抑制剂:最不起眼,也最不能省的一支
体系里同时有 RNA 靶标、逆转录产物和 T7 转录出的 RNA,一点核糖核酸酶(RNase)污染就可能让 RNA 通道失效。常见做法是加RNA 酶抑制剂(RNase Inhibitor),冻干体系里优先选无甘油版本。这类“辅助酶”用量不大,但往往是批间差异和现场失败率的来源。
该体系尚在实验室阶段,产品化方案清晰:冻干单管试剂、按压芯片配合手机判读,难点在于冻干和复溶稳定性。
冻干优化涉及缓冲体系、酶量、甘油残留、保护剂配比、冻干曲线、残水及复溶性能等多项参数;RPA 体系高蛋白、高 PEG 特性极易造成冻干塌陷、喷瓶或活性损失,推向产品还需验证批间一致性、运输稳定性、加速老化并完成注册。
此外规模化供应也是难点:研发阶段可优选酶原料,产业化则要求酶原料 CV 可控、产能成本稳定、持续供货,且多种酶活性需要匹配,更换供应商常需重新优化配方,这也是很多团队选择酶原料与冻干工艺放在同一个上游开发的原因。
优先落地场景包括生殖健康门诊、婚孕前检查、术前、献血筛查、基层及口岸公卫,这类场景要求快速出结果、设备轻便。
依托底物正交 Cas 体系开发呼吸道、发热、消化道等症候群面板;技术逻辑还可迁移至非洲猪瘟等动检、农残、食安与生物安全现场检测,适配等温冻干特性,这也需要原料与试剂端协同优化,支撑产品化。
| 产品类型 | 产品名称 | 货号 |
|---|---|---|
| RPA预混液 | DNA Rapid Isothermal Amplification Kit(Fluorescent) | 16702ES/16904ES |
| RNA Rapid Isothermal Amplification Kit(Fluorescent) | 16708ES/16905ES | |
| DNA Rapid Isothermal Amplification Kit(Chromatographi) | 16725ES/16906ES | |
| RNA Rapid Isothermal Amplification Kit(Chromatographi) | 16726ES/16907ES | |
| DNA Rapid Isothermal Amplification Kit (Basic) | 16727ES/16908ES | |
| RNA Rapid Isothermal Amplification Kit (Basic) | 16728ES/16909ES | |
| RPA单酶 | T4 UvsX Recombinase T4 UvsX重组酶 (2 μg/μL) | 11079ES |
| T4 UvsY protein T4 UvsY蛋白 (2 μg/μL) | 11080ES | |
| T4 Gene 32 Protein(gp32,10 μg/μL) | 14414ES | |
| T4 Gene 32 Protein, gp 32 (5 μg/μL) | 11081ES | |
| Bsu DNA Polymerase(Large fragment,50 U/μL) | 14415ES | |
| Bsu DNA Polymerase(Large fragment,5 U/μL) | 11078ES | |
| Creatine Kinase(2 μg/μL) | 14502ES | |
| Exonuclease III 核酸外切酶III (100 U/μL) | 14525ES | |
| 2× RPA Amplification Buffer 通用型RPA Buffer | 16928ES | |
| 逆转录酶 | Hifair UCF. ME® Advanced Reverse Transcriptase, Glycerol-free(200 U/μL) | 14617ES |
| Hifair® V Reverse Transcriptase (600 U/μL, Glycerol-free) | 11301ES | |
| T7 RNA聚合酶 | T7 RNA Polymerase(250 U/μL) | 10626ES |
| T7 RNA Polymerase GMP-grade(50 U/μL) | 10624ES | |
| T7 RNA Polymerase GMP-grade(250 U/μL) | 10625ES | |
| Hieff® T7 RNA Polymerase GMP-grade (low dsRNA, 250 U/μL) | 10629ES | |
| T7 High Yield RNA Synthesis Kit(low dsRNA) | 10633ES | |
| Cas蛋白 | ArCas12a Nuclease(10 μM) | 14702ES |
| AapCas12b Nuclease(10 μM) | 14808ES | |
| RNA酶抑制剂 | Murine RNase Inhibitor(200 U/μL,Glycerol-free) | 10703ES |
注:部分产品未上官网,可正常供货,详询当地业务员。
*资料来源:ACS Sensors(2026)Integrated Single-Step Duplex CRISPR-Based System for Point-of-Care Detection of Human Immunodeficiency Virus and Treponema pallidum Directly from Whole Blood;
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