通过对外泌体体外荧光标记示踪，可以对外泌体功能性进行研究，包括蛋白组学研究、外泌体活体成像实验、外泌体启动子活性研究等。目前荧光标记外泌体的方法有很多，主要包括亲脂性染料PKH-67/PKH-26、亲脂性羰花青染料DiI/DiD/DiO/DiR、以及渗透型的化合物标记法：CFSE/CFDA/Calcein-AM等。