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外泌体研究历程,你知多少?

外泌体(Exosome)参与细胞之间的交流,物质的运输以及正常生理过程的维持、还与许多疾病息息相关,目前越来越多的人做这方面的研究。关于外泌体提取、组成、“载体”和相应功能的精准分子机制近些年越来越受到关注,而且发表的有关外泌体的文章也在逐年增加。外泌体(Exosome)的研究历程主要包括外泌体提取与纯化、外泌体鉴定与检测、外泌体荧光标记、和外泌体的蛋白组学以及下游机制研究等。下面我们就简单介绍一下外泌体的研究历程。

 

 

1

什么是外泌体?

 

外泌体(Exosome)是一种由活细胞分泌到细胞外环境的膜性小囊泡,是细胞间信息传递的重要载体。外泌体天然存在于体液中,参与细胞间相互作用。

大小:直径约30~140 nm,比微泡小;

密度:密度约1.13~1.19g/ml

结构:双层膜囊泡状结构小体;

数量:人体中大约有1014个,平均每个细胞产生1000~10000个;

细胞源:人体中几乎所有类型的活细胞均能产生外泌体;

异质性:同一种细胞分泌的外泌体,也会存在功能区别;

• 分布:外周血、尿液、唾液、 乳汁、腹水、羊水等体液中;

• 外泌体产生于细胞中的多泡体。

 
 
 

2

外泌体组成与功能

 

外泌体(Exosome)携带大量特异性的蛋白质以及功能性的mRNAsmiRNAs等,在体内参与细胞通讯、细胞迁移、促血管新生和抗肿瘤免疫等生理过程,与多种疾病的发生和进程密切相关。不仅可以作为诊断多种疾病的生物指标,也可以作为治疗手段,未来有可能作为药物的天然载体用于临床治疗,是液态活检领域“三驾马车”之一以下为外泌体的提取、纯化、鉴定和分析过程。

图片.png
 1. 外泌体组分

 

 

3

外泌体分离

 

目前已经开发出多种外泌体(Exosome)提取方法包括:密度梯度,体积排阻,免疫磁珠和基于聚合物沉淀的方法。根据外泌体的体积,密度和表面标志物的不同进行分离,不同提取外泌体方法优劣势比较如下:

分离方法

分离原理

优点

缺点

超速离心法

根据颗粒的密度,大小,形态逐级离心

成本低;容量大; 试剂污染小。

仪器价格比较高;

操作时间比较长;

外泌体形态受损。

超滤法

超滤膜用于从蛋白质和其它大分子分离外泌体。外泌体群集中在膜上。

速度快; 不需要特殊仪器; 使用轻便。

压力会破坏外泌体;

吸附造成损失;堵塞滤膜。

体积排阻法

体积排阻层析分离基于它们的大小。它使用填充有多孔聚合珠的柱子。

纯度高;外泌体形态和活性较好; 重复性强; 上样量大

需要精密的仪器;

花费较大;

时间比较长。

外泌体沉降法

利用外泌体的溶解度或者分散性通过排水聚合物进行沉淀

使用方便;不需要特殊仪器; 可以大量制备。

 

非外泌体物质会发生共沉淀。 例如蛋白质,RNA,聚合物原料,需要进行样品的前处理和后处理

免疫磁珠法

通过外泌体表面蛋白的抗原抗体相互作用

特异性强; 纯度较高。

 

试剂价格昂贵; 适用性比较低; 产量较低; 只针对没有细胞的样品。

色谱法

根据外泌体的大小进行分离

得到的外泌体大小均一

设备特殊,价格高,应用不广泛

目前翌圣生物公司提供的细胞上清/血清血浆外泌体提取试剂盒(货号:41201ES25和41202ES,采用独特的分离技术,可以快速从细胞培养上清中获得大量完整的外泌体颗粒,适用于下游的细胞共培养、电镜分析、Western Blot、荧光定量(qPCR)和高通量测序等应用细胞上清外泌体抽提试剂实验流程如下:

图片.png
2. 细胞上清外泌体抽提试剂盒实验流程

 

 

4

外泌体鉴定

 

外泌体的功能研究第一步,即进行外泌体的鉴定。目前包括电镜法、NTA粒径法、WB法、核酸分析法等来鉴定外泌体的结构、特异性蛋白、核酸序列等。

形态分析--电镜法
 

在外泌体研究中,电镜能够直接观察到样品中外泌体的形态。并且具有很高的分辨率,能够鉴别大小不一的外泌体。但对样品的预处理和制备上面要求较高,样品的准备阶段比较复杂,不适合对外泌体进行大量快速的测量。而且由于外泌体经过了预处理和制备过程,无法准确的进行外泌体浓度的测量。

图片.png 

3. 电镜分析外泌体形态结构(图片来源:Current protocols in cellbiology(2006): 3-22

结构分析--NTA技术
 

NTA技术是表征外泌体浓度粒径测试手段之一,对不同大小的外泌体颗粒追踪和分析,计算出外泌体的直径和浓度。相较于其他表征方式,NTA技术的样本处理更简单、更能保证外泌体原始状态、检测速度更快。

图片.png 

4. NTA分析外泌体颗粒直径符合标准, 颗粒分散性好,大小均一。

蛋白鉴定-WB分析
 

WB分析典型的标记蛋白包括四跨膜蛋白超家族,如CD9CD63CD81定性鉴定检测需要选择至少2个指标才能达到文章发表要求,比如检测CD63TSG101外泌体鉴定试剂盒(货号:41203ES05 )是翌圣生物针对外泌体标志蛋白CD63TSG101检测而研发的一款高效且方便的产品试剂盒内的抗体经过严格筛选而得,适用于外泌体CD63和TSG101蛋白的检测。

该产品适用于人、大鼠、小鼠外泌体的鉴定。

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5. PCD63&TSG101阳性对照品;S为外泌体样品

核酸鉴定-qPCR法/NGS测序
 

外泌体中含有大量的RNADNA,包括功能性的 mRNAsmiRNAslncRNAmtDNA等,这些RNA分子以外泌体为载体进入靶细胞后,会通过不同的机制对靶细胞产生影响。可通过实时荧光定量PCR法、高通量测序技术分析外泌体RNA分子差异,是对外泌体RNA功能研究的有效手段。

图片.png

图6. qPCR法分析细胞上清液提取出的外泌体

 

 

5

外泌体荧光标记

 

通过对外泌体体外荧光标记示踪,可以对外泌体功能性进行研究,包括蛋白组学研究、外泌体活体成像实验、外泌体启动子活性研究等。目前荧光标记外泌体的方法有很多,主要包括亲脂性染料PKH-67/PKH-26、亲脂性羰花青染料DiI/DiD/DiO/DiR、以及渗透型的化合物标记法:CFSE/CFDA/Calcein-AM

 

 

6

外泌体相关FAQ

 

1. 不同样本提取外泌体参考体积?

 

 

样本体积(参考量

样本类型

电镜、NTA粒径、Western Blot

多基因核酸分析(qPCR)、NGS测序

细胞上清*

10-20 mL

40-60 mL

血清

1 mL

2 mL

血浆

1 mL

2 mL

尿液

20 mL

50-60 mL

脑脊液

10 mL

20-30mL

精液

1-2 mL

2-5 mL

唾液

5-10 mL

10-20 mL

腹水

10-20 mL

20-40 mL

羊水

10-20 mL

20-40 mL

乳液

5 mL

10-20 mL

2. 外泌体血液样本提取需注意事项?

全血经过长时间放置,冷冻、离心、会发生溶血现象,无法提取外泌体,必须做好血清血浆的分离。以及去除血清外源的外泌体。

3.如何去除血清外源的外泌体。

a.将细胞培养用的血清通过1×105g超速离心10h,去除血清外泌体;

b.选择无血清培养基进行细胞培养。

4.细胞上清外泌体提取试剂盒(货号:41202)可以提取哪些样本的外泌体?

细胞上清液、尿液(可直接提取)、脑脊液(需处理后再提取)。其他的组织液包括体液、唾液、卵泡液、精液等提取效率较低,建议客户用专门的组织液提取试剂盒。

5.如何提取组织细胞外泌体?

无菌环境下将组织剪成小块(越小越好),然后在无血清的培养基中培养12h;将培养液转移至离心管中,于4℃3000g离心20 min去除培养液中杂质和细胞碎片,将上清液转移至新的离心管中;先使用0.45μm滤器过滤上清液,接着使用0.2μm滤器过滤上清液,再按照本试剂盒说明书提取外泌体。

6.外泌体如何保存?

纯化后的外泌体可于 4℃保存不超过一周,-80℃条件下可长期保存,避免反复冻融。

 

 

7

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