MGISP-960在16S测序中的应用：粪便DNA样本的自动化文库构建流程
MGISP-960在16S测序中的应用：粪便DNA样本的自动化文库构建流程
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2026-10-09
建立适用于粪便DNA的16S自动化建库流程
MGISP-960（华大智造）
粪便样本提取的DNA
可选择翌圣MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit 磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒（Cat#18526）。
该产品适用于土壤、粪便、水样、水体滤膜、细菌、真菌等环境样本基因组DNA的提取。采用独特的磁珠和精心优化的缓冲体系，可最大限度的分离纯化样本中的微生物基因组DNA。提取的核酸纯度高，质量稳定可靠，适用于各种下游应用实验，如酶切、PCR、建库等。配合磁珠法自动化提取仪器使用，可实现核酸的高通量提取。
探秘“肠道微生态”：粪便菌群研究与16S rRNA测序的价值
人体肠道内定植着数以万亿计的微生物，构成了复杂的微生态系统，其结构与功能与健康息息相关。粪便作为肠道微生物的主要排泄载体，是研究肠道微生态最便捷、无创的样本来源。目前，16S rRNA测序是解析粪便菌群组成的经典技术——它通过扩增细菌基因组中保守的16S rRNA基因可变区，利用高通量测序快速鉴定样本中微生物的种类与相对丰度，为肠道微生态研究提供了高效工具。
基于16S rRNA测序，我们可以从粪便样本中深入挖掘以下关键信息，从而全面评估肠道健康与研究价值：
全面解析菌群组成与多样性
精准鉴定粪便样本中包含的细菌种类（从门、纲、目、科到属、种水平），并计算α多样性（样本内物种丰富度与均匀度）和β多样性（样本间群落结构差异），从而直观反映肠道微生态的复杂程度与稳定性。
挖掘疾病相关的生物标志物
通过对比健康人群与疾病人群（如结直肠癌、炎症性肠病、肠易激综合征等）的菌群差异，筛选出具有诊断潜力的特异性菌属或菌株。例如，某些致病菌（如具核梭杆菌）的富集或有益菌（如双歧杆菌、罗斯氏菌）的减少，往往与特定疾病的发生发展高度相关。
评估肠道屏障功能与免疫状态
分析菌群结构的变化可以间接反映肠道屏障的完整性。菌群失调往往伴随着肠道通透性增加，导致内毒素等有害物质入血，引发慢性炎症。通过检测，可以评估机体的免疫调节状态及潜在的炎症风险。
预测微生物代谢功能与营养状态
虽然16S测序主要针对物种分类，但结合生物信息学工具（如PICRUSt2），可以基于物种信息预测菌群的功能基因与代谢通路。这有助于了解肠道菌群在短链脂肪酸合成、维生素代谢等方面的能力，为个性化营养干预提供科学依据。
追踪环境粪便污染源
除了人类健康，该技术也广泛应用于环境科学。利用16S rRNA基因序列的宿主特异性，可以精准追踪水体等环境中的粪便污染来源（如区分人类、牛、猪等来源），为环境监测与公共卫生安全提供可靠的技术支持。
指导个性化健康干预与精准用药
基于检测结果，可以为个体量身定制饮食调整（如补充特定益生元）、益生菌补充或生活方式干预方案。同时，分析菌群对药物的代谢能力，有助于预判药物疗效与副作用，推动精准医疗的实现。
16S (V4) Bacterial AmpSeq Prep Kit For MGI /MGI平台16S扩增子建库试剂盒（Cat#12933）
MGI文库
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耗材名称 |
品牌 |
货号 |
所需数量 |
|
250μL盒装滤芯透明无菌吸头 |
Yeasen |
83130ES |
6.5盒 |
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0.2mL 96孔PCR板，白色，全裙边 |
Yeasen |
83560ES |
6块 |
|
96孔深孔板，U底（1.3 mL) |
Yeasen |
83672ES |
6块 |
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样本序号 |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
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样本类型 |
人粪便 |
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|
投入量 |
10ng |
||||
|
样本核酸浓度 |
4.3 |
7.92 |
5.56 |
5.42 |
5.48 |
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PCR Master Mix |
12.5 |
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|
16s Primer Mix |
2 |
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扩增循环数 |
28 |
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一轮纯化 |
22.5ul磁珠,25ul无酶水洗脱 |
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二轮投入量 |
取3ul一轮纯化产物 |
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Hieff Canace Amplification Mix |
12.5ul |
||||
|
primer |
2ul |
||||
|
扩增循环数 |
6cc |
||||
|
二轮纯化 |
22.5磁珠,25ul无酶水洗脱 |
||||
|
浓度（ng/ul） |
96.2 |
99.8 |
97.4 |
104 |
105 |
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文库胶图 |
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产品类别 |
产品名称 |
货号 |
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核酸提取 |
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18527ES |
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16SrRNA建库试剂盒 |
16S（V3-V4）Bacterial AmpSeq Prep Kit For Illumina/ Illumina平台16S扩增子建库试剂盒 |
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6S（V3-V4）Bacterial AmpSeq Prep Kit For MGI |
12833ES |
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6S（V4）Bacterial AmpSeq Prep Kit For Illumina |
12834ES |
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多重扩增Mix |
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多重高保真Mix |
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16S全长扩增 |
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MGI建库接头 |
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Illumina建库接头 |
Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina®Set1/Set2/Set3/Set4（板式） |
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纯化磁珠 |
Hieff NGS® DNA selection Beads (Superior Ampure XP alternative)DNA纯化分选磁珠 |
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文库定量 |
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自动化耗材 |
83130ES |
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|
83560ES |
||
|
83672ES |
