高难度皮肤组织RNA提取的"通关指南"

高难度皮肤组织RNA提取的"通关指南"

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2026-10-16

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高难度皮肤组织RNA提取的"通关指南"

— 实测案例:16通道核酸提取仪 + 18605试剂提取大鼠皮肤组织RNA

一

为什么组织RNA提取这么难?

组织RNA提取,是分子生物学、疾病机制研究、转录组测序、qRT-PCR乃至mRNA疫苗开发中最基础也最关键的"第一公里"。但相比细胞、细菌样本,组织样本的RNA提取难度堪称"地狱级":组织中含有大量纤维结构(如皮肤中  的胶原蛋白)、脂肪(脂肪组织)、RNase活性(胰腺、脾脏),加之RNA本身"见酶就降解、见水就水解"的脆弱特性,使得组织RNA提取对试剂、耗材、操作手法、自动化设备都有着严苛的要求。

本文将结合大鼠皮肤组织这一典型"难提样本"的实测案例(翌圣生物18605试剂 + 16通道核酸提取仪,80512),系统梳理组织RNA提取的原理、标准步骤、常见误区,并给出翌圣生物全流程产品方案推荐,一次性拿到浓度高、完整性好、纯度达标的RNA。

二
磁珠法RNA提取的原理

磁珠法是当前高通量、自动化组织RNA提取的主流方案,其核心原理可拆解为"裂解—结合—洗涤—消化—洗脱"五大步骤,每一步都有其化学与物理意义。

image.png

三
组织RNA提取的标准步骤(磁珠法+自动化平台)

以皮肤组织(纤维多、脂肪含量中等、RNase活性中等)为例,规范化的磁珠法自动化RNA提取通常包括以下步骤:

01
样本前处理

取15~30 mg新鲜或冻存皮肤组织(建议立即液氮速冻后-80℃保存),放入预冷的2 mL EP管中,加入适量研磨磁珠与裂解液,置于组织研磨仪中高速研磨,使组织彻底匀浆化。研磨后室温放置5 min让裂解液充分作用。

02
离心取上清

5000 rpm离心3 min,取450 μL含RNA的上清液,加入预装好裂解液/磁珠的96深孔板的板位中。注意:脂肪层要去除,避免堵塞磁珠。

03
自动化程序运行

将96深孔板正确放入16通道核酸提取仪(翌圣80512)内,启动预设程序。仪器按说明书注释自动完成:裂解结合→磁吸弃上清→洗涤液A洗涤→洗涤液B洗涤→DNase I消化(消化基因组DNA)→二次洗涤→洗脱。最终洗脱液即为RNA溶液,体积通常40~100 μL。

04
质量评估

取1~2 μL RNA溶液,使用Nanodrop/分光光度计测定浓度与纯度:

1)

A260/A280比值应在1.9~2.1之间(蛋白质残留越低越接近2.0)

2)

A260/A230比值应>1.8(碳水化合物、盐、酚类残留越低越接近2.0)

3)

高质量RNA的Nanodrop峰图应呈现平滑的单峰曲线,A260处峰值明显,无杂峰。

完整性评估推荐用琼脂糖凝胶电泳(28S/18S/5S rRNA三条带)或Bioanalyzer(RIN值≥7为合格,≥8为优秀)。

四
实测案例:16通道核酸提取仪+18605试剂提取大鼠皮肤组织RNA
01
测试目的

验证18605组织RNA提取试剂盒搭配大鼠新鲜皮肤组织样本,在16通道核酸提取仪(翌圣80512)上的提取性能,包括RNA得率、纯度与稳定性。

02
试剂&耗材&仪器

类别

名称

货号

试剂盒

组织RNA提取试剂盒

18605

耗材

无水乙醇

—

耗材

异丙醇

—

仪器

16通道核酸提取仪

80512

仪器

Nanodrop

—

耗材

96深孔板

83671

耗材

带卡口8连磁棒套

83663

耗材

2.0 mL EP管

83514

03
操作流程简述
1)
试剂准备:

DNase I与10× Buffer用DEPC水稀释10倍备用;洗涤液B按说明书加入无水乙醇

2)
样本前处理:

-80℃冻存皮肤组织转移至2 mL EP管,加入磁珠,组织研磨仪研磨,室温放置5 min;5000 rpm离心3 min,取450 μL上清加入96深孔板"板位1"

3)
 程序设置:

核酸提取仪紫外灯照射30 min后,按预设程序(裂解-磁吸-洗涤-DNase消化-二次洗涤-洗脱)运行;中间蜂鸣后人工加入700 μL洗涤液B至"板位4",继续运行至结束

4)
 RNA收集:

程序结束后,将洗脱板各孔中溶液转移至RNase-free离心管,短期4℃、长期-80℃保存。

04
实验结果

本次共提取13例大鼠皮肤组织样本,浓度与纯度数据如下:

样本编号

浓度 (ng/μL)

A260/A280

A260/A230

1

655.3

1.97

1.92

2

762.4

1.98

1.85

3

1029.2

1.96

1.84

4

500.9

1.98

1.97

5

1788.3

2.07

1.99

6

1106.9

2.05

1.95

7

764.4

1.97

1.79

8

1566.2

2.09

2.08

9

1446.5

2.08

2.01

10

801.6

2.03

1.94

11

1133.8

2.08

2.11

12

740.8

2.02

1.90

13

1039.7

2.05

1.92

05
结论

使用16通道核酸提取仪(翌圣80512)搭配18605组织RNA提取试剂盒提取大鼠皮肤组织RNA:

1)
浓度表现优异:

13例样本(剔除样本3)平均浓度约1058 ng/μL,最高1788.3 ng/μL,完全满足下游NGS、qRT-PCR等高灵敏度实验的RNA投入量需求

2)
纯度全面达标:

A260/A280比值集中在1.96~2.09,均落在1.9~2.1的优秀区间;A260/A230比值大部分>1.8,盐与有机溶剂残留极低

3)
 自动化平台优势显著:

一次可同时处理16例样本,全程"加样-裂解-洗涤-DNase消化-洗脱"自动化完成,人工操作仅需加入洗涤液B一步,节省80%以上人工成本。

五
组织RNA提取关键参数速查表

关键环节

推荐参数

作用

注意事项

组织投入量

15~30 mg

平衡得率与杂质

过多易堵塞磁珠

磁珠用量

20~40 μL

决定RNA结合容量

根据组织类型调整

吸磁时间

20 s~2 min

影响磁珠回收率

磁力过强易吸碎磁珠

洗涤次数

≥2次

去除蛋白与盐

洗涤液B含乙醇需现配现用

DNase I消化

37℃ 10~30 min

去除基因组DNA

消化后必须二次洗涤

洗脱体积

40~100 μL

影响终浓度

仪器最低设置≥100 μL

保存条件

-80℃长期 / 4℃短期

防止RNA降解

避免反复冻融

六
翌圣生物组织RNA提取配套产品推荐

组织RNA提取的关键是"裂解能力强+磁珠质量稳定+自动化适配性高+耗材严密防污染"。翌圣生物提供从试剂盒、磁珠耗材到自动化仪器的一站式方案,覆盖15~30 mg组织投入量的标准化提取需求,全流程兼容、可重复性极佳。

产品类型

产品名称

产品货号

应用要点

磁珠法组织RNA提取试剂盒

MolPure® Tissue RNA Kit

18605ES

适配16通道/96通道自动化平台,含DNase I

16通道核酸提取仪

Auto-Pure 16 Nucleic Acid Extractor

80512

一次处理16样本,含紫外消毒、程序可定制

96深孔板

96-Well Deep Well Plate

83671ES

适配翌圣全系列核酸提取仪,RNase-free

带卡口8连磁棒套

8-Strip Magnetic Rod Sleeve

83663ES

适配翌圣全系列磁棒架,防交叉污染

DEPC处理水

DEPC-treated Water

10612ES

RNase-free,配置溶液及洗脱用

无水乙醇/异丙醇

客户自备

—

AR级别即可,洗涤液B现配现用

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