高难度皮肤组织RNA提取的"通关指南"
高难度皮肤组织RNA提取的"通关指南" 
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2026-10-16
高难度皮肤组织RNA提取的"通关指南"
— 实测案例:16通道核酸提取仪 + 18605试剂提取大鼠皮肤组织RNA
一
组织RNA提取,是分子生物学、疾病机制研究、转录组测序、qRT-PCR乃至mRNA疫苗开发中最基础也最关键的"第一公里"。但相比细胞、细菌样本,组织样本的RNA提取难度堪称"地狱级":组织中含有大量纤维结构(如皮肤中 的胶原蛋白)、脂肪(脂肪组织)、RNase活性(胰腺、脾脏),加之RNA本身"见酶就降解、见水就水解"的脆弱特性,使得组织RNA提取对试剂、耗材、操作手法、自动化设备都有着严苛的要求。
本文将结合大鼠皮肤组织这一典型"难提样本"的实测案例(翌圣生物18605试剂 + 16通道核酸提取仪,80512),系统梳理组织RNA提取的原理、标准步骤、常见误区,并给出翌圣生物全流程产品方案推荐,一次性拿到浓度高、完整性好、纯度达标的RNA。
磁珠法是当前高通量、自动化组织RNA提取的主流方案,其核心原理可拆解为"裂解—结合—洗涤—消化—洗脱"五大步骤,每一步都有其化学与物理意义。

以皮肤组织(纤维多、脂肪含量中等、RNase活性中等)为例,规范化的磁珠法自动化RNA提取通常包括以下步骤:
取15~30 mg新鲜或冻存皮肤组织(建议立即液氮速冻后-80℃保存),放入预冷的2 mL EP管中,加入适量研磨磁珠与裂解液,置于组织研磨仪中高速研磨,使组织彻底匀浆化。研磨后室温放置5 min让裂解液充分作用。
5000 rpm离心3 min,取450 μL含RNA的上清液,加入预装好裂解液/磁珠的96深孔板的板位中。注意:脂肪层要去除,避免堵塞磁珠。
将96深孔板正确放入16通道核酸提取仪(翌圣80512)内,启动预设程序。仪器按说明书注释自动完成:裂解结合→磁吸弃上清→洗涤液A洗涤→洗涤液B洗涤→DNase I消化(消化基因组DNA)→二次洗涤→洗脱。最终洗脱液即为RNA溶液,体积通常40~100 μL。
取1~2 μL RNA溶液,使用Nanodrop/分光光度计测定浓度与纯度:
A260/A280比值应在1.9~2.1之间(蛋白质残留越低越接近2.0)
A260/A230比值应>1.8(碳水化合物、盐、酚类残留越低越接近2.0)
高质量RNA的Nanodrop峰图应呈现平滑的单峰曲线,A260处峰值明显,无杂峰。
完整性评估推荐用琼脂糖凝胶电泳(28S/18S/5S rRNA三条带)或Bioanalyzer(RIN值≥7为合格,≥8为优秀)。
验证18605组织RNA提取试剂盒搭配大鼠新鲜皮肤组织样本,在16通道核酸提取仪(翌圣80512)上的提取性能,包括RNA得率、纯度与稳定性。
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类别 |
名称 |
货号 |
|
试剂盒 |
组织RNA提取试剂盒 |
18605 |
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耗材 |
无水乙醇 |
— |
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耗材 |
异丙醇 |
— |
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仪器 |
16通道核酸提取仪 |
80512 |
|
仪器 |
Nanodrop |
— |
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耗材 |
96深孔板 |
83671 |
|
耗材 |
带卡口8连磁棒套 |
83663 |
|
耗材 |
2.0 mL EP管 |
83514 |
DNase I与10× Buffer用DEPC水稀释10倍备用;洗涤液B按说明书加入无水乙醇
-80℃冻存皮肤组织转移至2 mL EP管,加入磁珠,组织研磨仪研磨,室温放置5 min;5000 rpm离心3 min,取450 μL上清加入96深孔板"板位1"
核酸提取仪紫外灯照射30 min后,按预设程序(裂解-磁吸-洗涤-DNase消化-二次洗涤-洗脱)运行;中间蜂鸣后人工加入700 μL洗涤液B至"板位4",继续运行至结束
程序结束后,将洗脱板各孔中溶液转移至RNase-free离心管,短期4℃、长期-80℃保存。
本次共提取13例大鼠皮肤组织样本,浓度与纯度数据如下:
|
样本编号 |
浓度 (ng/μL) |
A260/A280 |
A260/A230 |
|
1 |
655.3 |
1.97 |
1.92 |
|
2 |
762.4 |
1.98 |
1.85 |
|
3 |
1029.2 |
1.96 |
1.84 |
|
4 |
500.9 |
1.98 |
1.97 |
|
5 |
1788.3 |
2.07 |
1.99 |
|
6 |
1106.9 |
2.05 |
1.95 |
|
7 |
764.4 |
1.97 |
1.79 |
|
8 |
1566.2 |
2.09 |
2.08 |
|
9 |
1446.5 |
2.08 |
2.01 |
|
10 |
801.6 |
2.03 |
1.94 |
|
11 |
1133.8 |
2.08 |
2.11 |
|
12 |
740.8 |
2.02 |
1.90 |
|
13 |
1039.7 |
2.05 |
1.92 |
使用16通道核酸提取仪(翌圣80512)搭配18605组织RNA提取试剂盒提取大鼠皮肤组织RNA:
13例样本(剔除样本3)平均浓度约1058 ng/μL,最高1788.3 ng/μL,完全满足下游NGS、qRT-PCR等高灵敏度实验的RNA投入量需求
A260/A280比值集中在1.96~2.09,均落在1.9~2.1的优秀区间;A260/A230比值大部分>1.8,盐与有机溶剂残留极低
一次可同时处理16例样本,全程"加样-裂解-洗涤-DNase消化-洗脱"自动化完成,人工操作仅需加入洗涤液B一步,节省80%以上人工成本。
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关键环节 |
推荐参数 |
作用 |
注意事项 |
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组织投入量 |
15~30 mg |
平衡得率与杂质 |
过多易堵塞磁珠 |
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磁珠用量 |
20~40 μL |
决定RNA结合容量 |
根据组织类型调整 |
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吸磁时间 |
20 s~2 min |
影响磁珠回收率 |
磁力过强易吸碎磁珠 |
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洗涤次数 |
≥2次 |
去除蛋白与盐 |
洗涤液B含乙醇需现配现用 |
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DNase I消化 |
37℃ 10~30 min |
去除基因组DNA |
消化后必须二次洗涤 |
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洗脱体积 |
40~100 μL |
影响终浓度 |
仪器最低设置≥100 μL |
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保存条件 |
-80℃长期 / 4℃短期 |
防止RNA降解 |
避免反复冻融 |
组织RNA提取的关键是"裂解能力强+磁珠质量稳定+自动化适配性高+耗材严密防污染"。翌圣生物提供从试剂盒、磁珠耗材到自动化仪器的一站式方案,覆盖15~30 mg组织投入量的标准化提取需求,全流程兼容、可重复性极佳。
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产品类型 |
产品名称 |
产品货号 |
应用要点 |
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磁珠法组织RNA提取试剂盒 |
适配16通道/96通道自动化平台,含DNase I |
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16通道核酸提取仪 |
一次处理16样本,含紫外消毒、程序可定制 |
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96深孔板 |
适配翌圣全系列核酸提取仪,RNase-free |
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带卡口8连磁棒套 |
适配翌圣全系列磁棒架,防交叉污染 |
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DEPC处理水 |
RNase-free,配置溶液及洗脱用 |
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无水乙醇/异丙醇 |
客户自备 |
— |
AR级别即可,洗涤液B现配现用 |





