在高通量测序技术日新月异的当下,small RNA(涵盖 miRNA、siRNA、piRNA 等)研究已然成为探索生命调控奥秘的关键领域。而基于T4 RNA连接酶的建库技术,作为small RNA研究的核心环节,却长期受两大技术难题困扰:
①连接效率欠佳:传统T4 RNA连接酶对短链RNA适配性不足,极易产生接头自连等副产物,致使文库出现严重偏好性;
②末端偏好性显著:普通酶易受RNA二级结构或末端修饰影响,从而导致数据偏差。

图1.传统T4 RNA连接酶在small RNA建库中的应用流程示意图[1]
如今,T4 RNA连接酶2截短型(T4 RNA Ligase 2, truncated,T4 Rnl2tr)的问世,彻底改写了small RNA建库技术格局。该酶能够特异性催化5´端预腺苷化的DNA/RNA与RNA 3´-OH末端的连接反应。其独特之处在于无需ATP参与,不过必须搭配5´端预腺苷化接头使用。当它与T4 RNA ligase 1协同运作时,可实现打断RNA的直接接头连接,有效遏制接头串联和自连现象,大幅提升测序文库的构建质量。

图2.T4 Rnl2tr联合T4 RNA ligase 1在small RNA建库中的应用流程示意图[2]
在此,我们向您推介翌圣生物全新研发的T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ(Cat#14653)。这款酶作为T4 Rnl2tr的双点突变体(R55K, K227Q),在保持高效连接活性的同时,极大程度降低了RNA的非特异性连接问题,诸如 RNA 串联或自连成环等情况,堪称small RNA 3'端接头连接和cDNA文库构建的绝佳之选。
目前,翌圣生物已成功构建起完备的T4 RNA连接酶产品矩阵,包括T4 RNA ligase 1、T4 RNA ligase 2和T4 RNA ligase 2, truncated KQ,满足您多样化的科研需求。其特点及应用见下表:
T4 RNA连接酶类型 |
(Cat#14651) |
(Cat#14652) |
(Cat#14653) |
连接特性 |
单链RNA连接 |
双链RNA连接 |
预腺苷化的5'端DNA或RNA与RNA的3'端连接 |
ATP依赖性 |
是 |
是 |
否 |
连接子要求 |
不需要预腺苷化的连接子 |
不需要预腺苷化的连接子 |
需要预腺苷化的连接子 |
酶活性 |
高 |
高 |
高,相比T4 Rnl2tr,减少副产物,连接活性一致 |
特点 |
无特定突变 |
无特定突变 |
ATP非依赖性,K227Q突变减少了酶的赖氨酸腺苷化活性, R55K突变提高了酶的连接活性 |
优势 |
广泛应用于单链RNA连接 |
广泛应用于双链RNA连接 |
优化了连接效率,减少了副产物 |
应用 |
1. ssRNA分子内/间连接和环化; 2. ssRNA和ssDNA分子间连接; 3. 单链Oligo RNA的合成; 4.miRNA等5’端RNA在克隆、建库或PCR检测时接头添加、cDNA文库构建。 |
1. 连接双链RNA中缺刻的连接; 2. RNA 3'羟基与DNA 5'磷酸基的缺刻连接; 3. 在RNA夹板的帮助下实现ssRNA末端的连接,但不适用于短RNA前体。 |
miRNA等3’端羟基的单链RNA在克隆、建库或PCR检测时接头添加、cDNA文库构建。 |
性能展示
翌圣T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ(Cat#14653)
超强切割活性,媲美进口品质
使用翌圣和来自进口Supplier A*的T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ分别按照不同投入量加入体系中对31 nt的ssRNA底物(Substrate 1)和17 nt预腺苷化的ssRNA底物(Substrate 2)进行连接实验。结果表明,翌圣产品能高效连接 ssRNA 底物,连接效果与进口产品不相上下。

图3.T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ连接效果验证
无核酸外切酶、切口酶、RNase酶残留
将200 U T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ分别与核酸底物孵育,并通过琼脂糖凝胶电泳分析谱带变化。实验结果表明,翌圣的3个批次T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ均未检测出核酸外切酶、切口酶或RNase 残留,为您的实验结果准确性与可靠性保驾护航。

图4.T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ核酸外切酶、切口酶、RNase残留检测结果
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产品名称 | 货号 | 规格 |
T4 RNA ligase 2, truncated KQ (200 U/μL) | 14653ES90 | 5 KU |
活动细则:
1、活动时间:即日起-5月15日;
2、活动名额有限,每位客户限一套。
参考文献:
[1] Raabe C A , Thean-Hock T , Juergen B ,et al.Biases in small RNA deep sequencing data[J].Nucleic Acids Research, 2014(3):1414-1426.DOI:10.1093/nar/gkt1021.
[2] Sorefan K , Pais H , Hall A E ,et al.Reducing ligation bias of small RNAs in libraries for next generation sequencing[J].Silence, 2012, 3(1):4-4.DOI:10.1186/1758-907X-3-4.