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RPA可冻干原料介绍

RPA可冻干原料介绍

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2026-09-22

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RPA(Recombinase Polymerase Amplification,重组酶聚合酶等温扩增)是一种于2006年首次报道的核酸等温扩增技术,由英国Birmingham大学科学家开发。与qPCR依赖精确的温控循环不同,RPA在37-42℃的恒温条件下,仅需15-30分钟即可实现核酸分子的指数级扩增,灵敏度可达单拷贝水平(1-10 copies/反应)。

RPA的反应机理高度依赖三种核心酶的协同作用,理解每种酶的功能,是理解RPA可冻干原料体系的前提。

重组酶(Recombinase)

重组酶是RPA反应的"导航系统"。最常用的重组酶来源于T4噬菌体(gp32蛋白)或相关嗜热菌。重组酶在ATP和Mg²⁺的存在下,与寡核苷酸引物形成复合物。该复合物能够扫描双链DNA,当发现与引物序列互补的区域时,引发链置换反应(strand exchange),将引物定位到靶序列上。

单链结合蛋白(SSB)

单链结合蛋白(SSB)在RPA反应中负责稳定被引物置换出的单链DNA(ssDNA),防止其重新配对形成二级结构(如发卡结构)或与亲本链重新退火。SSB的存在确保了引物延伸的顺畅进行。SSB与重组酶之间存在竞争关系——SSB过强会阻碍重组酶扫描DNA,SSB过弱则无法有效稳定ssDNA,导致扩增效率下降。最优的SSB浓度需要通过实验筛选确定。

DNA聚合酶

RPA通常使用具有强链置换活性的B型DNA聚合酶。该酶在引物3'端进行延伸,通过链置换机制推动前方的双链DNA结构,完成扩增。与Taq酶不同,Bsu polymerase的最适温度为30-37℃,属于中等温度偏好的酶,这一温度特性与RPA的等温扩增体系天然匹配。

01

为什么RPA原料需要可冻干版本?

常规RPA试剂以液体形式提供,储存于-20℃或2-8℃。对于POCT应用场景,液体试剂面临几个现实问题:需要冷链运输和储存,增加了配送成本;用户需要自行配制反应体系,操作步骤较多;效期受储存温度影响大,高温环境下稳定性下降。可冻干版的RPA试剂解决了这些问题;冻干状态下酶的化学稳定性显著提高,有效期可达室温储存12个月以上。对于宠物医院POCT(猫瘟/犬细小病毒检测)、食品安全快速检测(沙门氏菌、李斯特菌)、野外病原体筛查等应用,RPA可冻干原料都是核心技术支撑。

02

可冻干RPA原料的质量评价标准有哪些?

灵敏度验证(LOD测试)

使用已知拷贝数的标准品(基因组DNA或质粒标准品),以10倍梯度稀释法测定冻干RPA试剂的LOD。建议测试范围1-1000 copies/反应,要求LOD应≤100 copies/反应(以质粒标准品为参考)。批间LOD差异:不同批次冻干品对同一标准品的LOD偏差应≤1个数量级(10倍以内)。

扩增效率验证

比较冻干前后RPA体系的扩增曲线:冻干后Ct值偏移应≤2个循环;扩增曲线形态(荧光强度上升速率、曲线光滑度)应与冻干前相近。

储存稳定性验证

将冻干RPA试剂在推荐储存条件下(通常2-8℃或25℃)放置30天和60天后,取样进行功能性验证。要求:30天储存后灵敏度下降≤1个数量级;Ct值偏移≤1.0。

加速老化测试(37℃,7天)作为批间快速筛查方法:37℃/7天后,关键性能指标(LOD、Ct值)应无显著恶化。

引物兼容性验证

使用3-5对不同引物(涵盖不同GC含量38%-62%、不同长度35-50 nt、不同目标区域)测试冻干RPA对不同靶标的扩增适应性。要求:所有测试引物对均能产生阳性扩增(灵敏度满足要求);不同引物对之间的Ct值差异应在合理范围内

翌圣生物可提供RPA等温扩增体系所需的核心可冻干酶原料,包括重组酶、单链结合蛋白和DNA聚合酶的优化冻干混合物,经功能性验证,冻干后扩增性能稳定,支持宠物诊断试剂开发企业客户的RPA冻干试剂盒开发。

对于有特定应用体系开发需求的客户,翌圣可配合进行RPA冻干原料在特定应用场景中的适配性评估,包括样本类型兼容性(粪便、全血、血清等)、引物探针设计优化建议、以及冻干工艺可行性评估。

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定位

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