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Hieff® LongSeq Plasmid Fragmentation and Ligation Module(三代全长质粒酶切建库模块)
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产品介绍

Hieff® LongSeq Plasmid Fragmentation and Ligation Module是针对三代Nanopore测序平台开发的质粒酶切建库模块,搭配13304ES即可完成质粒建库。该试剂盒适用于质粒建库,同时酶切末端修复加A尾后无需纯化,可直接进行Barcode连接,实验流程更便捷。

产品特色

l 兼容50 ng-1 µg。

l 文库制备时间约2 hour。

l 严格的批次性能与稳定性质控。

应用案例

全长质粒测序优势:

对比维度一代测序(Sanger测序)二代测序(NGS)三代测序(ONT/Pacbio)
核心技术链终止法,通过毛细管电泳读取序列大规模并行测序(如Illumina),先将DNA打断为短片段,拼接后获得完整序列单分子实时测序(如纳米孔测序),直接读取完整DNA分子,无需打断
读长约1000 bp200-500 bp,依赖复杂的片段拼接超长读长,可达几十kb甚至Mb级别,可直接覆盖质粒全长
优势准确度极高(99.999%),是传统的“金标准”高通量、成本低,可一次性对大量质粒进行测序无需引物设计,可“盲测”未知质粒。完美攻克复杂结构,如高GC含量、重复序列、发卡结构(如AAV的ITR区)。可直接检测DNA甲基化修饰
局限性通量低,测通一个质粒需设计多对引物进行“引物步移”,周期长、成本高。无法处理复杂结构,在重复序列处易“卡壳”读长短,对于重复序列等复杂区域的组装困难,可能丢失信息。依赖PCR扩增,可能引入扩增偏倚原始读长错误率较高(~Q20),但可通过测序深度校正,矫正后准确率可达99.9%(Q30)以上。
最佳应用场景局部区域验证,如单克隆位点、插入片段两端的序列确认大规模、常规质粒的批量验证,如质粒库的质控复杂质粒的完整性验证(含ITR、重复序列等)、基因治疗原料质控、未知质粒的从头测序

数据展示1:翌圣试剂在ONT平台质粒测序结果展示
实验方案:使用翌圣全长质粒建库试剂盒13305ES和马达蛋白接头连接模块13304加上针对ONT平台的barcode(13317ES/13318ES)对不同类型的质粒进行全长建库后,使用ONT测序仪进行测序。

表:不同质粒ONT平台全长测序结果展示

图:不同质粒全长测序后片段长度结果展示

图:不同质粒全长测序序列展示

数据展示2:翌圣试剂在ONT平台和序风(Cyclone)平台质粒测序比对结果展示

实验方案:使用翌圣全长质粒建库试剂盒13305ES和马达蛋白接头连接模块13304进行全长质粒建库后,在ONT和序风(cyclone)平台进行测序。

图:相同质粒在ONT和序风(cyclone)平台测序结果比较

数据展示3:AAV质粒的全长测序结果展示

表:AAV质粒全长测序的竞品对比展示

存储条件

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