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CY是花菁染料的缩写,经典的花菁染料结构包含两个含氮杂环,并通过甲川基组成的共轭链连接,共轭链长度(n值,可为奇数或偶数)可显著影响其电子基态下的平衡构型。染料分子共轭链的两端或中间常连接杂环、芳环或环烯等结构,共同构成大共轭体系,其骨架上的氢原子可被多种取代基修饰。此类CY系列染料广泛用于蛋白质、抗体及小分子化合物的标记,其中针对蛋白和抗体的标记通常可通过简易的混合反应实现。
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