Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for MGI®是针对MGI®高通量测序平台专业开发设计的新一代酶切法建库试剂盒。与传统的建库法比较,本品采用高质量的片段化酶,摆脱了繁琐的超声过程,同时简化了操作流程,将片段化模块与末端修复模块合二为一,极大的降低了建库的时间和成本。本试剂盒具有优秀的文库转化率,可应用于常规动植物基因组、微生物基因组等样本,同时能兼容FFPE DNA样本的建库。经测序验证,不同GC含量的样本,均可获得优异的测序结果,文库覆盖度高,均一性好,偏好性低,使建库变得更加简单高效。
- 适用10 ng-1 μg的基因组DNA、全长cDNA等样本
- 高质量片段化酶,可随机切割双链DNA,酶切片段无偏好性
- 片段化、末端修复/加A一步完成
- 强扩增效率的高保真酶,显著提高文库质量及产量
- 适用于FFPE DNA样本
- 严格的批次性能与稳定性质控
OnePot II DNA 建库试剂盒酶切 800 ng 小牛胸腺 gDNA 样本(不同酶切时间片段化效果检测)
图:800 ng 小牛gDNA酶切结果
使用本试剂盒进行 human gDNA 样本建库,文库进行电泳检测(Input DNA 为 50 ng,酶切 12 min,扩增 8 cycles)
图:human DNA建库结果图
-25~-15℃保存。
Q:13321和13322有什么区别?
A:13321适合样本起始量10 ng-1μg;13322适合样本起始量500 pg-1μg;
Q:片段化与样本量、酶切时间、样本片段长度有关吗?
A:与样本量和酶切时间有关,酶切时间越久,打断后的片段越短。但设置了小片段保护机制,最短可到100~150bp左右,投入量建议按照说明书推荐的量,超出范围的需要自行摸索体系。
Q:酶切法片段化后,大小与预期不符?
A:首先怀疑样本质量问题,是否纯度正常,杂质较多会影响酶活性;操作上是否时间把控不准确,导致过度酶切或者酶切不充分等,建议片段化体系在冰上配置,PCR仪片段化程序设置按照说明书进行,即开始酶切反应温度之前设置一个4℃的低温,避免过度酶切等。
[1] Liu K, Deng S, Ye C, et al. Mapping single-cell-resolution cell phylogeny reveals cell population dynamics during organ development. Nat Methods. 2021;18(12):1506-1514. doi:10.1038/s41592-021-01325-x(IF:28.547)