长接头带完整的 index 序列，所以接头连接的时候直接完成文库构建，此时如果文库浓度达到测序要求，那么可以直接PCR-Free 建库；短接头建库，接头连接步骤双端同时连接相同的 PE Adapter。序列如下：
PE Adapter for Illumina：
5 -/5Phos/ GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC -3
5 -ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT-3
其中黄色部分是Y 型接头配对的区域（12 bp）
而后必须必须经过 1-3 循环的扩增形成完整的接头序列。以单端为例：
Universal Primer for Illumina：
5 -AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT -3
蓝色部分（33 bp）与 PE Adapter 5 -ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT-3 互补延伸之后形成 i5
端。
Index Primer for Illumina：
5 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATXXXXXXXXGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATC-3
（ xxxxxxxx 代 表 index ） 红 色 部 分 (31 bp) 与 PE Adapter 5 -/5Phos/ GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC -3 互补延伸形成完整的 i7 端.