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新品|UCF.ME®超低残留热敏UDG酶,防治污染必不可少

操作环境中的气溶胶污染是造成PCR结果假阳性最常见的因素,美国科学家Lindahl最早在大肠杆菌和枯草芽孢杆菌中发现了UDG酶(Uracil DNA Glycosylase,尿嘧啶DNA糖基化酶),UDG酶与dUTP搭配使用,可建立PCR防污染体系。

图1. dUTP/UDG酶防污染系统去除残留扩增污染物示意图

 

目前市售UDG酶主要包括大肠杆菌和枯草芽孢杆菌来源的普通UDG酶及嗜冷海洋细菌来源的热敏型UDG酶两种类型。普通UDG酶较为耐热,经95℃、10 min处理仍会残留有少量的尿嘧啶-DNA糖基化酶活性,可能存在对靶标含dU扩增产物的降解作用。此外,由于商业化分子酶主要采用工程菌株(如大肠杆菌等)进行重组表达,因此分子酶中会存在一定量的宿主基因组DNA残留。加上制备环境和人源等因素影响,分子酶制品中极易存在污染DNA。在病原体检测过程中,污染的DNA可能会淹没低丰度的靶标核酸或和靶标核酸一起被检出,从而影响结果的判读。

 

 

翌圣生物UCF.ME®超低残留分子酶解决方案

 

为解决病原检测背景菌干扰问题,翌圣已建立完善的UCF.ME®超低残留分子酶研发、生产平台。通过对物料、环境、工艺、过程、质量等多环节把控,目前可规模化提供用于RT-qPCR检测,NGS建库的全套高性能、超低残留分子酶原料,助力解决病原检测中的背景菌干扰,提高检测准确度

 

图2. 翌圣超低残留分子酶研发、生产环节把控

 

 

翌圣生物UCF.ME®超低残留热敏UDG酶

 

翌圣UCF.ME® Uracil DNA Glycosylase (UDG/UNG), heat-labile, 1 U/μL (Cat#14466ES)来源于嗜冷海洋细菌,是一款UCF.ME®超低残留热敏UDG酶。该产品的使用可避免常规UDG酶灭活后可能存在的残留活性在常温下对含dU扩增产物的降解作用同时防止分子酶中存在的背景菌造成PCR结果假阳性,因此在检测过程中引入UCF.ME®低残留的热敏UDG酶,对于准确鉴别感染病原体,协助感染、传染病的临床诊断至关重要。

 

 

产品特点

 
  • UCF.ME®超低残留E. coli基因组DNA残留<0.1 copies/ 1 U;
  • 酸酶残留低:无核酸外切酶、切口酶、RNase残留;
  • 消化能力强:0.05 U/T即可消化105 copies/T dU-DNA产物;
  • 热敏性好:50℃ 10 min,55℃ 5 min或95℃ 5min以上任意条件都可完全被灭活;
  • 兼容RT-qPCR反应体系:在高投入量(2U/20μL反应体系)下对检测体系无影响。

 

 

性能展示

 
 
 
 

消化能力强

0.05 U/T即可消化105 copies/T dU-DNA产物

图3:使用14466ES配制qPCR mix,同时以不含UDG酶的qPCR mix为对照组,用于105 copies/T dU-DNA产物的消化和扩增。结果显示:在14466ES投入量达0.05U/T时能完全消化105 copies/T dU-DNA产物。

 

 
 
 

热敏性好

50℃ 10 min,55℃ 5 min或95℃ 5min以上任意条件都可完全被灭活

图4:取14466ES分别在下述条件:50℃,10min;55℃,5min;55℃,10min;95℃,5min进行热灭活处理,使用不同条件下灭活处理的14466ES配制成qPCR mix,同时以不含UDG酶的qPCR mix为对照组,用于dU-DNA产物的消化和扩增。结果显示:经过50℃,10min;55℃,5min;55℃,10min;95℃,5min热灭活处理后的14466ES均失去消化能力。

 

 
 
 

兼容RT-qPCR反应体系

在高投入量(2U/T)下对检测体系无影响

图5:使用新冠ORF1ab和N基因两种引物探针搭配14466ES配制成RT-qPCR mix,同时以不含UDG酶的RT-qPCR mix为对照组,对新冠RNA模板参考品进行扩增,结果显示:当14466ES投入量为2U/20μL反应体系时,对RT-qPCR反应无抑制。

 

 

FAQ

 
UDG酶可以用于已存在的扩增产物气溶胶污染吗?
已存在的扩增产物气溶胶污染不含dU,此时UDG酶不能发挥作用。建议选取其他扩增区域,重新设计引物,并建立dUTP/UDG酶防污染系统,即可避免“未来”的气溶胶污染。

UDG酶用于RT-qPCR或RT-PCR体系时,会干扰逆转录实验吗?

可选用耐受性能良好的逆转录酶,如Hifair® V Reverse Transcriptase(Cat#11300ES)反应温度50-55℃,此时热敏UDG酶活性极低。
UDG酶会切割RNA吗?
不会。在生物体内,UDG酶在DNA修复过程中发挥重要作用。它可以修复dC脱氨基形成dU的突变,进而避免GC碱基对突变为AT碱基对的可能。

UDG酶反应Buffer是什么?

UDG酶可以在各类缓冲液中发挥作用,如常规的Taq酶Buffer、连接酶Buffer、酶切Buffer等。
UDG酶对DNA链的碱基个数有要求吗?
不能从6碱基或更少的寡核苷酸上水解尿嘧啶。

 

 

UCF.ME®低残留RT-qPCR系列分子酶原料清单

 

 

产品定位

产品名称

产品货号

防污染热敏UDG

UCF.ME® Uracil DNA Glycosylase (UDG/UNG), heat-labile, 1 U/μL

14466ES

热启动Taq酶

Hieff UCF.ME® Hotstart Sensitive Taq DNA Polymerase (5 U/μL)

14314ES

逆转录酶

Hifair UCF.ME® V Reverse Transcriptase (200 U/μL)

14608ES

鼠源RNase抑制剂

UCF.ME® Murine RNase Inhibitor (40 U/μL)

14672ES

 

 
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