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上新 | ThermoSalt RNA Ligase 2,耐盐·耐热的 dsRNA 连接酶新选择

上新 | ThermoSalt RNA Ligase 2,耐盐·耐热的 dsRNA 连接酶新选择

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2026-10-27

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RNA 连接是 RNA 基础研究与应用开发中的核心操作:双链 RNA 切刻(nick)封闭、RNA 片段拼接、体外环状 RNA 制备,均依靠连接酶在 5′- 磷酸基团与 3′- 羟基之间高效、特异地形成 3′-5′磷酸二酯键。连接酶的催化效率,直接决定了这类反应的效果。

经典的T4 RNA Ligase 2 是双链 RNA 切刻连接常用工具酶,其最适反应温度约 37 ℃,有效工作区间4‑37 ℃;盐耐受能力弱,当NaCl 浓度超过 100 mM 后活性快速衰减,难以适配复杂RNA底物、高盐反应体系,以及需要高温解链消除 RNA 二级结构的工艺场景。

针对现有酶的性能局限,翌圣生物自主研发 ThermoSalt RNA Ligase 2 (70 μM)(Cat#14656ES),实现耐热性、耐盐性双重性能提升。

该 ATP 依赖型 dsRNA 连接酶,反应温度窗口宽达 25‑70 ℃,70 ℃高温、300 mM NaCl 高盐条件下仍保留良好连接活性,为酶法连接提供了更宽的反应条件窗口。该酶可催化双链 RNA 内的切刻连接,也支持 DNA 夹板介导的 RNA 底物切刻连接。

图1. ThermoSalt RNA Ligase 2 工作原理示意图

核心优势

基于上述特性,ThermoSalt RNA Ligase 2 在耐热性、耐盐性、温度窗口与底物兼容性上形成了差异化优势:

耐高温性能

70 ℃ 高温条件下仍保留 50% 以上连接活性,可与需要高温解链或高温处理的步骤衔接,对结构复杂的 RNA 底物也能获得更好的连接效果。

耐高盐性能

300 mM NaCl 高盐体系下仍具活性,可直接在含盐体系中进行连接,减少为迁就低盐条件而额外稀释、换液的操作。

宽温度窗口

25–70 ℃ 范围内均可反应,25 ℃、45 ℃、70 ℃ 下均验证有效,适配不同底物与工艺条件。

底物兼容性

可连接双链 RNA 中的切刻,也适用于以 DNA 为夹板的 RNA 底物切刻连接,并兼容 2′-F、2′-OMe、2′-F/OMe 修饰 dsRNA。

翌圣 ThermoSalt RNA Ligase 2(14656ES)数据展示

基础连接活性:同等酶量下优于经典 T4 RNA Ligase 2

图2. ThermoSalt RNA Ligase 2 与 T4 RNA Ligase 2 连接活性比较

注:在相同酶投入量梯度(0.25 / 0.125 / 0.063 / 0.031 U)下进行连接反应,ThermoSalt RNA Ligase 2 的连接效率优于 T4 RNA Ligase 2。(ThermoSalt RNA Ligase 2 活性约为 30 U/μL,即70 pmol≈30 U)

耐热性能:70 ℃孵育 30 min,保留 50% 以上连接效率

图3. 不同反应温度下 ThermoSalt RNA Ligase 2 与 T4 RNA Ligase 2 的耐热性比较

注:在 25–90℃ 温度梯度下比较(酶投入量 0.25 U,反应 30 min)。T4 RNA Ligase 2 随温度升高活性迅速下降;ThermoSalt RNA Ligase 2 在 70℃ 反应 30 min 连接效率仍可保留 50% 以上,耐热性显著优于 T4 RNA Ligase 2。

耐盐验证:300 mM NaCl 下仍保留 50% 以上连接活性

图4. 不同盐离子浓度下 ThermoSalt RNA Ligase 2 与 T4 RNA Ligase 2 的耐盐性比较

注:在 0–300 mM NaCl 梯度下比较(酶投入量 0.25 U)。T4 RNA Ligase 2 随盐浓度升高活性快速下降;ThermoSalt RNA Ligase 2 在 300 mM NaCl 条件下连接效率仍可保留 50% 以上,耐盐性显著优于 T4 RNA Ligase 2。

功能验证:

01夹板依赖型 RNA 连接活性优于 T4 RNA Ligase 2

图5. Splint夹板DNA介导的RNA连接活性对比

02可高效连接 2′-F、2′-OMe 及 2′-F/OMe 修饰 dsRNA

图6. 2′-F、2′-OMe及2′-F/OMe混合修饰dsRNA连接活性验证

注:反应条件:酶量0.3U,37℃,1h,2mMMgCl₂。A:2′-F修饰dsRNA;B:2′-OMe修饰dsRNA;C:2′-F/OMe混合修饰dsRNA;D:未修饰dsRNA。

0325 ℃、45 ℃、70 ℃ 下均可有效连接,25 ℃ 连接效率最高

图7. 不同温度(25℃、45℃、70℃)下修饰dsRNA连接效果。

注:A:2′-F修饰dsRNA;B:2′-OMe修饰dsRNA;C:2′-F/OMe混合修饰dsRNA。

042–5 mM Mg²⁺ 浓度下连接效率最佳

图8. 不同Mg²⁺浓度(2/5/10mM)下修饰dsRNA连接效果

注:反应条件:酶量0.3U,45℃,1h。A:2′-F修饰dsRNA;B:2′-OMe修饰dsRNA;C:2′-F/OMe混合修饰dsRNA;NC:无酶阴性对照;PC:未修饰底物阳性对照。

产品推荐
产品名称 产品货号 特性 典型应用
ThermoSalt RNA Ligase 2 14656ES 耐高温(70℃)、耐高盐(300 mM NaCl)的 dsRNA 连接酶,ATP 依赖,兼容 2′-F/2′-OMe 修饰底物 双链 RNA 切刻连接、环状 RNA 体外合成、夹板介导的 RNA 片段连接、天然/修饰RNA底物高温拼接、smallRNA建库的 3′ 接头连接

系列产品推荐,适配全场景实验需求

为满足不同实验场景下的 RNA 连接需求,翌圣生物提供完整的 RNA 连接酶产品矩阵,一站式覆盖 RNA 切刻连接、环状 RNA 合成、small RNA 建库等多元应用。下表汇总各产品的推荐反应条件、辅因子与主要应用,便于快速选型。

产品(货号) 推荐反应温度 热失活 辅因子 主要应用 产品特点
ThermoSalt RNA Ligase 2(14656ES) 25–70 ℃ ≥2 mM EDTA ATP 双链 RNA 切刻连接、环状 RNA 体外合成、夹板介导的 RNA 片段连接、天然/修饰RNA底物高温拼接、smallRNA建库的 3′ 接头连接 耐 300 mM NaCl;兼容 2′-F/2′-OMe 修饰底物;内部方法测活 30 U/μL
T4 RNA Ligase 2(14652ES) 25 ℃ 80 ℃ 5 min ATP 双链 RNA 切刻连接、环状 RNA 体外合成、夹板介导的 RNA 片段连接 对 dsRNA 切刻的活性显著高于单链 RNA 末端连接
T4 RNA Ligase 1(14651ES) 37 ℃ 65 ℃ 15 min ATP 单链 RNA/DNA 分子间、分子内连接;RNA 环化;small RNA 建库 5′ 接头连接; 连接单链 RNA 效率最高;加 15%–25% PEG-8000 可提升效率
T4 RNA Ligase 2, truncated KQ(14653ES) 25 ℃ 65 ℃ 20 min 无(需 5′-预腺苷化底物) small RNA 建库 3′ 接头连接 R55K/K227Q 双突变,显著减少 RNA 串联与自连成环
T4 RNA Ligase 2, truncated K227Q(14655ES) 25 ℃ 65 ℃ 20 min 无(需 5′-预腺苷化底物) small RNA 建库 3′ 接头连接; MBP 融合;K227Q 突变减少副产物
RtcB Ligase(14658ES) 37 ℃ — GTP + Mn²⁺ ssRNA 分子间连接与环化;3′-磷酸或 2′,3′-环磷酸底物连接 生成 GMP 活化 3′-磷酸末端;困难底物可加 15% PEG-8000
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