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肠道微生物检测专题介绍

肠道微生物检测专题介绍

89

2026-11-09

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引言:肠道菌群——人体不可忽视的“第二基因库”

人体肠道定植超100万亿微生物,总重量超1kg,编码基因总量是人类自身基因组的150倍,被学界称为人体第八大器官、第二大脑。肠道菌群分为有益共生菌、中性条件致病菌、有害致病菌三大类,参与营养合成、肠道屏障构建、全身免疫调控、脑-肠轴信号传导等核心生理活动,现代研究证实95%人体亚健康与慢性疾病均和肠道菌群失衡直接相关。

现代人饮食精细化、抗生素滥用、长期压力、作息紊乱等因素极易破坏菌群稳态,引发便秘腹泻、肥胖、过敏、2型糖尿病、心血管疾病,甚至抑郁症、阿尔茨海默病等神经类疾病。传统肠镜、血液检测仅能反映器质性病变,无法提前预判微生态失衡带来的长期健康风险。肠道微生物高通量测序检测凭借无创、精准、前瞻性优势,成为健康管理、临床辅助诊断、菌群干预评估的核心技术手段。本文系统梳理肠道微生物检测的样本要求、检测内容、主流测序技术优劣对比,并完整介绍翌圣生物覆盖核酸提取、扩增子建库、宏基因组建库全流程配套试剂方案,为第三方医学检验、科研机构、体检中心提供一站式解决方案。

肠道菌群核心生理功能与菌群失衡危害
01

肠道菌群四大核心生理价值”

1)营养代谢供给

菌群分解人体无法消化的膳食纤维,生成短链脂肪酸;自主合成B族维生素、必需氨基酸,保障能量吸收与基础营养供给;调控胆汁酸代谢,平衡脂质与糖代谢水平。

2)构筑肠道生物屏障

有益菌定植肠黏膜表层,竞争性抑制致病菌黏附,降低毒素入血,修复肠道黏膜损伤,减少肠漏、慢性炎症发生概率。

3)全身免疫调控中枢

人体70%免疫细胞集中于肠道,菌群持续刺激免疫细胞成熟,平衡免疫应答,降低自身免疫病、过敏性疾病发病风险。

4)脑-肠轴双向信号调控

菌群分泌5-羟色胺等神经递质,通过内分泌、免疫通路作用于中枢神经,直接影响情绪、睡眠、认知能力,与焦虑、抑郁、老年痴呆高度关联。

02

菌群失衡诱发多系统健康问题”

菌群有益菌丰度下降、致病菌异常增殖时,会形成连锁式健康损伤:

1. 消化系统:长期腹胀、反复腹泻、顽固性便秘、肠易激综合征、炎症性肠病;

2. 代谢系统:肥胖、胰岛素抵抗、2型糖尿病、高血脂、脂肪肝;

3. 免疫与过敏:反复过敏、慢性炎症、自身免疫紊乱;

4. 神经系统:失眠、情绪低落、焦虑抑郁、认知衰退;

5. 远期慢病风险:结直肠肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病风险升高。

肠道微生物检测基础信息:样本、检测范围、报告核心内容
01

样本类型与采集要求”

肠道微生物检测统一采用粪便样本,单次采样≥0.5g即可完成全流程测序分析,属于完全无创采样,无辐射、无侵入操作,适配全年龄段人群(婴幼儿、成人、老年人)。

粪便基质富含胆汁盐、多糖、腐殖酸等强PCR抑制物,宿主人类DNA占比超99%,样本核酸提取难度高,提取质量直接决定测序数据真实性,是整个检测流程的关键瓶颈。

02

完整检测报告四大模块”

1)菌群整体基础评估

菌群α/β多样性、F/B厚壁菌/拟杆菌比值、有益菌/有害菌丰度、机会致病菌检出情况,直观判断肠道微生态平衡状态

2)消化道亚健康症状匹配评估

针对便秘、腹泻、胀气、腹痛、易胖、易疲劳等临床常见症状,匹配对应特征菌群丰度做关联性解读

3)多系统疾病风险预判

覆盖代谢慢病、自身免疫病、神经精神疾病、肠道肿瘤等13类疾病相关菌群模型,可提前5-10年提示潜在患病风险

4)个性化健康干预指导

评估短链脂肪酸、维生素合成、毒素降解能力,配套专属膳食方案、运动、作息、益生菌补充建议,实现精准个体化肠道调理。

03

适用检测人群”

1. 存在消化道不适人群:长期便秘、腹泻、腹胀、肠易激;

2. 代谢异常人群:肥胖、血糖血脂偏高、脂肪肝;

3. 免疫敏感人群:反复过敏、易感冒、慢性炎症;

4. 精神睡眠异常人群:失眠、焦虑、情绪低落;

5. 中老年慢病高危人群:糖尿病、心血管病史、认知下降;

6. 健康管理需求人群:日常体检、产后调理、儿童生长发育评估;

7. 抗生素长期使用者、菌群移植前后疗效监测人群。

肠道微生物两大主流测序技术原理、优劣与适用场景

目前行业标准化检测技术分为16S rRNA扩增子测序与宏基因组mNGS测序两类,技术维度、成本、分析深度差异明显,可根据检测需求灵活选择。

表1 16S rRNA测序 vs 宏基因组测序综合对比

对比维度

16S rRNA(V3-V4 区)扩增子测序

宏基因组 mNGS 测序

核心原理

靶向扩增细菌 16S 保守高变区,高通量测序解析群落结构

提取粪便全部微生物总 DNA,无差别全基因组测序

可检测微生物

仅细菌,鉴定至属 / 部分种水平

细菌、真菌、病毒、古菌,精准到菌株级

数据内容

物种丰度、菌群多样性、群落差异

物种组成 + 功能基因 + 代谢通路 + 耐药基因 + 毒力因子

优势

实验流程短、成本低、样本通量高,适合大规模筛查

分析维度全面,可筛查未知病原、解读菌群功能

短板

无法解析微生物代谢功能,无菌株分辨率

测序数据量大、成本高、分析周期长,宿主 DNA 干扰强

适用场景

常规体检、群体菌群普查、基础多样性科研、菌群初筛

疑难肠道疾病、未知感染溯源、菌群功能深度研究、粪菌移植精准评估

翌圣生物肠道微生物检测全流程配套试剂解决方案

针对粪便样本抑制物繁多、宿主DNA干扰强、扩增效率差、文库产量不稳定等行业难题,翌圣生物凭借自研分子酶核心技术,构建核酸提取-扩增子建库-宏基因组建库-纯化磁珠一体化闭环试剂体系,兼容Illumina、MGI主流测序平台,可高效替代进口试剂,兼具高稳定性与高性价比。

01

粪便微生物核酸提取:MolPure®粪便DNA提取试剂盒(18820ES)”

专为粪便复杂样本优化,可高效去除胆汁盐、腐殖酸等各类PCR抑制物,彻底消除下游扩增、建库抑制风险。强效裂解体系可充分裂解革兰氏阳性菌,显著提升低丰度菌群检出率,200mg粪便样本最高可提取30μg高纯微生物DNA。产物可直接用于16S扩增、宏基因组建库、qPCR检测,无需二次纯化。全程室温柱式操作、无有机试剂,适配手动及自动化高通量实验场景。

02

16S扩增子测序全套试剂(常规菌群筛查首选)”

16S(V3-V4)扩增子建库试剂盒(12983ES):适配肠道菌群经典V3-V4扩增区域,搭配通用引物与自研高保真热启动酶,有效避免低丰度菌群扩增偏好,文库产量稳定、菌群定量精准,性能比肩进口产品。搭配标签索引试剂盒(17265ES)支持多样本并行测序,有效降低单样本检测成本。配套分选磁珠可精准回收目标片段,去除杂片段与引物二聚体,减少无效测序数据。

03

宏基因组mNGS建库试剂(临床深度诊断/高端科研)”

OnePot Flash一步法建库试剂盒(12316ES):单管一体化完成片段化、末端修复、加A尾,仅需5分钟即可完成片段化,大幅缩短建库周期。适配100pg–500ng低起始量粪便DNA,严控背景污染,有效降低宿主DNA干扰,双测序平台通用。

EvoMax DNA建库试剂盒(12972ES):搭载新一代自研高保真酶体系,文库均一性优异,高度适配粪便、肠道组织等复杂样本,可满足菌株分型、菌群机制研究等高精尖科研需求。

总结

肠道微生物检测是从“疾病治疗”转向“主动健康预防”的核心工具,通过无创粪便测序,精准评估微生态平衡、提前预警慢病风险、指导个性化饮食与菌群干预。16S扩增子测序适合大众化筛查,宏基因组测序满足深度临床与科研需求,两种技术互为补充。翌圣生物深耕分子酶与NGS建库试剂领域,针对粪便样本高抑制、低微生物载量等行业痛点,打造从核酸提取到文库构建的全链条国产试剂方案,为医学检验实验室、体检机构、科研单位、诊断试剂企业提供完整肠道微生物检测技术支撑,助力国内微生态检测行业标准化、国产化高质量发展。

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应用

货号

名称

土壤粪便等环境样本提取

18527ES

Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit 2.0

细菌 真菌DNA提取

18565ES

Hieff NGS®Fast Tagment DNA Library(for 50 ng)Prep Kit for Illumina®

酶切法

12316ES

Hieff NGS® OnePot Flash DNA Library Prep Kit

转座酶法

13468ES

Hieff NGS® C112P1 Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 1 ng)

12207ES

Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina(for 50ng)

rRNA去除

12258ES

Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit(Human)

Total RNA建库

12308ES

Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit

cDNA酶切建库

13488ES

Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit

13501ES

Hieff NGS® C37P3 ds-cDNA Synthesis Kit(gDNA digester plus)

12317ES

Hieff NGS® OnePot  DNA Library Prep Kit

逆转录

12249ES

Hieff NGS® 1st Strand Synthesis Kit

逆转录

12946ES

Hieff NGS® 1st cDNA Synthesis Kit

多重PCR扩增

17228ES

Hieff NGS® Multiplex Long PCR Master Mix

多重扩增试剂

12948ES

4×Hieff® Multiplex PCR Master Mix(快速)

多重扩增试剂

12977ES

4× Hieff® Multiplex PCR Master Mix 2.0 4× 多重PCR预混液

一步法RT-mPCR

12950ES

4×Hieff® Multiplex RT-PCR Master Mix(UDG plus)

16S(V3-V4)

12983ES

16S(V3-V4)Bacterial Metagenomic Library Construction Kit For Ilumina

16S(V4)

12834ES

16S(V4)Bacterial AmpSeq Prep Kit For Illumina

16S(V3-V4)

12833ES

16S(V3-V4)Bacterial Metagenomic Library Construction Kit For MGI

16S(V4)

12933ES

16S(V4)Bacterial Metagenomic Library Construction Kit For MGI

Illumina接头

12327ES

Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina®, Set1

12328ES

Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina®, Set2

12329ES

Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina®, Set3

12330ES

Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina®, Set4

MGI接头

13350ES

Hieff NGS® Unique Dual Barcode Primer Kit for MGI®, Set1

13351ES

Hieff NGS® Unique Dual Barcode Primer Kit for MGI®, Set2

13352ES

Hieff NGS® Unique Dual Barcode Primer Kit for MGI®, Set3

13353ES

Hieff NGS® Unique Dual Barcode Primer Kit for MGI®, Set4

双链DNA(dsDNA)定量

12642ES

1×dsDNA HSAssay Kit/dsDNA HS Assay Kit

DNA纯化磁珠

12601ES

Hieff NGS® DNA Selection Beads  DNA分选磁珠

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