我是表观能手|spike in的常见Q&A

CUT&tag spike in的优势想必大家都有所了解,但是关于spike in的优势以及分析内容,童鞋们可能还有各种疑问,小翌今天带大家继续深入了解。
 

Q1:关于spike in,传统的基因组的spike in和我们这种已知片段的spike in的差异?

A1:传统的果蝇基因组的spike in和我们这种片段化的spike in,在实验室,都是添加的恒量,但是在实验环节有差异。传统的基因组spike in,是在实验开始时加入,这样在后续实验中,有更多的变数来影响spike in的恒量。而片段化的spike in,在Tn5酶切时添加,整体影响spike in的变数较少。

 

 Q2:为什么要添加三段不同片段长度的spike in?

A2:添加三段不同片段长度和不同比例的spike in,不管是建库还是qPCR,三段spike in都能互相校正,减少实验对spike in的影响。 

 

Q3:Spike in的数据分析怎么做?

A3:关于CUT&tag数据分析,Henikoff实验室公布了标准的分析流程,分析流程里有spike in的标准化怎么处理,以及分析脚本。 

 

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最后,小翌同步最新消息。翌圣“我是表观能手”进入大众投票环节了!

 

本次“我是表观能手”活动设置各种奖品:便携影院P3S 坚果投影仪、华为运动智能手表GT3、YSL口红、小爱音箱等

 

前期,该活动收集到的数据已经由翌圣生物邀请的专家(中国科学技术大学与附属第一医院鲍老师、北京大学伊成器教授课题组孟老师、华中农业大学李兴旺教授课题组欧阳老师、上海嘉因生物科技有限公司生信总监韦老师以及武汉爱基百客生物科技有限公司高级技术专家赵老师)和翌圣生物内部评审专家进行评分。
目前,该活动已经进入大众投票环节,大众投票采用群内投票原则进行投票。


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此次投票群为CUT&tag技术交流群,群内含有国内外各个科研院校的表观研究老师们,可以进行探讨技术。加翌圣微信,即可加入CUT&tag技术交流群。

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延伸阅读

CUT&tag实验spike in的优势早知道

 

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