上新 酶切法DNA建库再进阶:产量更高,数据更优!
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2026-09-04
在肿瘤精准诊疗时代,NGS(下一代测序)已成为辅助诊断、伴随诊断、MRD监测、早筛早诊、遗传性肿瘤检测等应用场景的核心技术。而在整个NGS检测流程中,建库是至关重要的环节——建库的质量直接影响测序结果的准确性与可靠性。酶切法建库避免了传统的机械打断,无需打断仪,流程简便,可同时处理多个样本,更适合自动化建库,是目前应用最广泛的建库方法之一。
然而,肿瘤样本的特殊性对建库试剂盒提出了苛刻的要求,酶切法建库也存在酶切偏好性、假阳性、起始量适用范围窄等方法学局限。翌圣生物借助ZymeEditor酶改造及发酵纯化工艺平台,对酶进行进化改造,并不断优化反应体系,在经典产品的基础上全新升级,推出Hieff NGS® OnePot Evo DNA Library Prep Kit(Cat#12193ES),让酶切法建库更高效、更精准!
肿瘤NGS检测中,从提取、建库、捕获到测序,每一个环节的效率都会影响到低频突变的检出率。基于NGS的肿瘤全景变异检测,对DNA建库试剂盒有四大核心要求:
▪低质量FFPE样本、微量cfDNA样本的建库成功率高;
▪接头连接效率高、文库扩增效率高;
▪片段化带来的假阳性低;
▪扩增无偏好性。
同时,肿瘤样本类型多样 ——FFPE、血浆、胸腹水、全血 / 骨髓血,样本质量参差不齐。以 12194ES 为代表的一步法建库试剂盒已在多家三方医检所客户中稳定应用,文库产量与酶切片段化大小均表现稳定;然而,针对低质量 FFPE 样本,若希望在保障稳定性的基础上进一步提升文库产量,12193ES 应运而生。
◆产品特点:
▪适用5 ng - 1 μg的基因组DNA、全长cDNA等样本,兼容FFPE DNA样本;
▪高质量片段化酶,可随机切割双链DNA,酶切片段偏好性低;
▪片段化、末端修复/加A一步完成;
▪强扩增效率的高保真酶,显著提高文库质量及产量;
◆实验流程

优势一:文库产量显著提升
以小牛gDNA为模板,考察5 ng - 1 μg不同投入量的建库表现。
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Input DNA |
5 ng |
50 ng |
500 ng |
1 μg |
|
cycles |
10 |
6 |
3 |
3 |
|
文库产量(ng) |
1530~1836 |
2634~2718 |
2814~2928 |
3120~3150 |
数据显示,12193在5 ng微量起始到1 μg高通量投入的全范围内均能获得高产量的文库。
优势二:片段大小灵活可调
以Human gDNA 200 ng为模板,进行酶切时间梯度测试(3 - 20 min),不同酶切时间对应稳定的产物大小

◆酶切时间梯度:3min、5min、7min、10min、12min、15min、17min、20min
数据显示,通过简单调整酶切时间即可精准控制文库片段大小,满足不同Panel与测序平台的插入片段需求。
优势三:捕获数据质量全面优异
▸对比SupplierA(全外显子Panel,标准品NA12878):
数据显示,12193的Properly比对率、Coverage、嵌合体比例(diff chr)显著优于SupplierA,数据指标基本一致且质量更优。
▸对比12194、Supplier B(FFPE样本靶向捕获,0.2M Panel,200 ng input,5 cycles):

| Sample | Map Ratio (%) | Dup (%) | Reads Capture (%) | Mean Depth | Coverage (%) | 0.2 Mean Depth X Coverage (%) | Soft Clip (%) | Chimeric (%) | Hairpin Artifacts Reads | RPM |
| HYF--12193 | 99.95 | 26.83 | 80.37 | 4037.09 | 100.00 | 99.35 | 1.92 | 0.72 | 14.00 | 4.93 |
| HYF--Supplier B | 99.94 | 29.98 | 80.01 | 3900.99 | 100.00 | 99.08 | 2.11 | 0.93 | 17.00 | 6.00 |
| FG--12193 | 99.91 | 18.19 | 65.87 | 3647.78 | 100.00 | 99.57 | 2.17 | 0.78 | 20.00 | 7.05 |
| FG--Supplier B | 99.89 | 19.91 | 65.56 | 3606.87 | 100.00 | 99.24 | 2.32 | 0.92 | 24.00 | 8.47 |
| WZF--12193 | 99.95 | 29.44 | 83.13 | 3996.99 | 100.00 | 99.81 | 1.80 | 0.50 | 24.00 | 7.18 |
| WZF--Supplier B | 99.94 | 35.54 | 82.71 | 3614.11 | 100.00 | 99.86 | 2.07 | 0.82 | 23.00 | 8.13 |
数据显示,相同的样本、相同的投入量、相同的循环数,12193的文库产量最高;Map Ratio、Duplication Rate、Reads Capture率、Mean Depth、Chimeric、Hairpin Artifacts Reads等指标最佳。综合评估:12193的文库产量和数据质量整体优于Supplier B。
▸海外客户FFPE样本实测案例:
数据显示,12193相比客户原有FFPE建库方案:Duplication Rate显著降低(全部通过<40%阈值);Uniformity、Mean Coverage普遍更高,捕获效率更稳定;有效靶向碱基比例显著提升(19.6%→24.3%);SNV一致性保持100%。
优势四:假阳性水平可控
FFPE回顾性临床样本验证(200 ng input,杂交捕获后对比):
数据显示,12193相对Supplier D突变检出个数更少,说明假阳性更小;回顾性样本中两种试剂报告的突变个数一致,检测到的CNV和MSI结论完全一致。
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产品名称 |
产品货号 |
产品规格 |
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12193ES08 |
8 T |
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12193ES24 |
24 T |
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12193ES96 |
96 T |





