华大基因MGI平台整体解决方案
“基因科技，造福人类”是华大基因坚持不变的使命，近几年随着华大技术的不断突破，测序平台的不断完善，华大基因已经成为国产高通量测序仪的中坚力量。
“国产试剂，助力中国智造”，致力于成为分子酶产业创新引领者，翌圣生物一直保持对高通量测序技术的高度关注，并长期专注于分子酶原料及建库试剂盒等产品研发和生产，加上与华大平台的密切合作，现推出华大平台建库的完整解决方案，可满足主流的测序应用。
解决方案part1
Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for MGI®(13310ES)
——全能型DNA建库试剂盒，建库试剂“终结者”
★适用样本类型广： cfDNA、FFPE在内的所有样本均能获得优异文库
★应用范围广：应用于全基因组测序、靶向捕获测序、Chip-seq等
★两大秘密武器：极高效连接酶与强扩增效率高保真酶
★品质稳定：严格的批次性能与稳定性质控
数据展示：
1）13310建库试剂盒适用于不同样本，均可高效建库
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Template |
1 ng—cfDNA |
50 ng—小牛超声 |
10 ng—FFPE超声 |
|||
|
建库试剂 |
小样 |
对照 |
小样 |
对照 |
小样 |
对照 |
|
Cycles |
13 |
8 |
10 |
|||
|
Concentration (ng/μL) |
32.6 29.6 |
30.2 30.4 |
87.6 82.8 |
82.6 79.0 |
59.6 68.0 |
50.4 53.6 |
|
Average |
31.1 |
30.3 |
85.2 |
80.8 |
63.8 |
52.0 |
|
Total(ng) |
995.2 |
969.6 |
2726 |
2585 |
2041 |
1664 |
2）使用13310建库试剂可获得高质量的测序数据
全基因组测序（WGS）
样本信息：human cell line N12878
试剂盒：Yeasen机械Vs MGI demo
测序类型：MGISEQ-2000 High-throughput Sequencing Set (PE 150)
数据分析：MegaBOLT+GATK
结论：Yeasen机械法建库试剂，上机测试结果与华大demo相比，SNP变异检测性能一致，INDEL变异检测性能更高。
|
Yeasen-超声约150ng |
MGI-demo |
|||
|
1-1 |
1-2 |
2-1 |
2-2 |
|
|
Raw bases (bp) |
92238502500 |
86419274400 |
95887631200 |
95354400400 |
|
GC content (%) |
41.19 |
41.16 |
41.55 |
41.56 |
|
Clean Q20 (%) |
95.615 |
95.53 |
97.13 |
97.115 |
|
Clean Q30 (%) |
86.475 |
86.285 |
89.915 |
89.925 |
|
Mapping rate (%) |
99.42 |
99.41 |
99.36 |
99.33 |
|
Duplicate rate (%) |
0.83 |
0.79 |
2.5 |
2.51 |
|
snp_Precision |
0.9989 |
0.9987 |
0.9988 |
0.9986 |
|
snp_Sensitivity |
0.9905 |
0.9918 |
0.9816 |
0.9854 |
|
snp_F-measure |
0.9947 |
0.9952 |
0.9901 |
0.992 |
|
indel_Precision |
0.9459 |
0.9431 |
0.932 |
0.9322 |
|
indel_Sensitivity |
0.9189 |
0.9105 |
0.8766 |
0.8759 |
|
indel_F-measure |
0.9322 |
0.9265 |
0.9034 |
0.9032 |
解决方案part2
Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for MGI® (13321ES)
——酶切法建库试剂盒，引领酶切“一步法”
★操作简便：样本片段化到接头连接，一管内完成；
★高效的片段化酶：偏好性极低，完美替代转座酶法建库；
★投入量范围广：500 pg-1 μg DNA样本实现稳定建库；
★试用样本多：基因组DNA、全长cDNA、FFPE DNA样本。
数据展示：
1）高效酶切，酶切产物片段大小只与酶切时间有关，与样本的投入量和样本的GC含量均无相关性。
2）适用多样本建库，不同投入量，酶切均可高效建库
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Template |
500pg 小牛 |
2ng-小牛 |
100ng-小牛 |
5ng-FFPE |
10ng-FFPE |
|||||
|
建库试剂 |
小样 |
对照 |
小样 |
对照 |
小样 |
对照 |
小样 |
对照 |
小样 |
对照 |
|
Cycles |
14 |
11 |
7 |
11 |
11 |
|||||
|
Concentration (ng/μL) |
14.0 |
17.5 |
17 |
16.6 |
114 |
93.8 |
22.6 |
17.3 |
34.0 |
31.2 |
|
Total(ng) |
448 |
560 |
544 |
531.2 |
3648 |
3001.6 |
723.2 |
553.6 |
1088 |
998.4 |
3）酶切建库可获得高质量测序数据
全基因组测序（WGS）
样本信息：human cell line N12878
试剂盒：Yeasen酶切法Vs Enzy* 酶切
测序类型：MGISEQ-2000 High-throughput Sequencing Set (PE 100)
数据分析：MegaBOLT+GATK
结论：Yeasen酶切法建库试剂盒对比Enzy* 酶切法建库，SNP变异检测性能更强，INDEL变异检测性能更高。
|
Yea-50ng-酶切 |
Enzy-50ng-酶切 |
|||
|
3-1 |
3-2 |
4-1 |
4-2 |
|
|
Raw bases (bp) |
109966280700 |
101567894100 |
90543565800 |
107930258600 |
|
GC content (%) |
41.17 |
41.23 |
40.43 |
40.25 |
|
Clean Q20 (%) |
98.205 |
98.315 |
98.405 |
98.36 |
|
Clean Q30 (%) |
92.66 |
93.005 |
93.425 |
93.255 |
|
Mapping rate (%) |
99.55 |
99.57 |
99.58 |
99.56 |
|
Duplicate rate (%) |
2.49 |
2.8 |
2.32 |
2.63 |
|
snp_Precision |
0.9988 |
0.9987 |
0.9975 |
0.9978 |
|
snp_Sensitivity |
0.9905 |
0.988 |
0.9819 |
0.9839 |
|
snp_F-measure |
0.9946 |
0.9933 |
0.9897 |
0.9908 |
|
indel_Precision |
0.913 |
0.9091 |
0.8888 |
0.89 |
|
indel_Sensitivity |
0.9026 |
0.8911 |
0.8477 |
0.8639 |
|
indel_F-measure |
0.9078 |
0.9 |
0.8678 |
0.8768 |
解决方案part3
Hieff NGS® Fast-Pace DNA Cyclization Kit for MGI®(13341ES)
——高效环化试剂盒，兼容主流建库试剂
★适用范围广：兼容主流建库试剂盒（KAPA、华大等）；
★快速环化：1小时快速环化，产物满足DNB制备；
★环化效率高： cfDNA环化效率>30%，其它样本>40%；
★品质稳定：严格的批次性能与稳定性质控。
解决方案part4
Hieff NGS® MaxUp II Dual-mode mRNA Library Prep Kit for MGI®
——兼容常规链与链特异性建库试剂盒，mRNA建库“一盒双用”
★样本适用范围广：耐高温，适合复杂模板 mRNA 建库；
★片段化可控：片段大小均可选择合适的打断条件；
★文库质量优异：多样本类型测试，结果均能满足不同客户需求；
★测序质量优异： rRNA 残留更低，有效数据占比更多。
解决方案part5
Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI® (13360ES)
配套接头——满足96种样本数据的拆分
Hieff NGS® DNA Selection Beads (12601ES)
精准分选——完美替换AMPure XP
dsDNA HS Assay Kit for Qubit® (12640ES)
双链DNA定量神器——5min精确定量文库
产品信息
|
产品信息 |
名称 |
货号 |
规格 |
|
全能型建库试剂盒 |
13310ES08/16/96 |
8/16/96T |
|
|
酶切法建库试剂盒 |
13321ES08/16/96 |
8/16/96T |
|
|
mRNA建库试剂盒 |
Hieff NGS® MaxUp II Dual-mode mRNA Library Prep Kit for MGI® |
13331ES08/16/96 |
8/16/96T |
|
环化试剂盒 |
13341ES08/16/96 |
8/16/96T |
|
|
rRNA去除试剂盒 |
12253ES08/24/96 |
8/24/96T |
|
|
接头 |
13360-62 |
4/16/100T |
|
|
磁珠 |
12601ES08/56/75 |
5/60/450mL |
|
|
Qubit定量 |
12640ES60/76 |
100/500T |
