TSS（转录起始位点）富集效果不佳通常可能由以下原因导致：（1）实验样本细胞活性不佳，或细胞核完整性受损（如存在较多游离DNA建议对细胞或细胞核进行镜检，确认其完整性。（2）可尝试优化实验条件，例如调整裂解液成分、控制酶反应温度与时间等，以减少游离DNA干扰并提升TSS富集效率。